В начале XX века Омск был уже достаточно крупным городом, его форштадты были густо заселены. В связи с этим в 1915 году в поселке Игнатовка Кривощековского форштадта было выделено 1000 кв. саженей земли под строительство церкви, которую будут посещать местные жители. Деньги на строительство дало омское Общество хоругвеносцев.
Это поселение располагалось на восточной окраине города. В 1919 году церковь названная в честь Николая Чудотворца была освящена, хотя и не до конца достроена: не было колокольни и куполов. Создавалась она по проекту А.П. фон Гогена, так же как и знаменитый Скорбященский храм.
В 1939 году здание церкви отдают под клуб школе № 13, в 1940 – в ней размещался военный склад, а позже работал кинотеатр «Экран».
Только в 1989 году церковь признали памятником архитектуры и передали Омско-Тарской епархии.
Николо-Игнатьевская церковь находится в трех километрах от Омской крепости на правом берегу Оми у бывшего Горбатого моста. Этот район несколько лет назад назывался Ремесленные, поскольку состоял из сети Ремесленных улиц. Здесь преобладает одноэтажные частные дома. Заглянув сюда, сложно представить, что находишься в центре города с миллионным населением.