Один из первых храмов, построенных в Омске, – Никольский Казачий Собор возводился в 1833-1843 годах как казачья войсковая церковь. Автором проекта был известный русский архитектор В.П. Стасов, Собор, как и большинство его творений, имеет черты русского классицизма, стиля ампир. Однако проект был дополнен омскими архитекторами: они добавили колокольню и притвор. Построенный Собор посвятили святым: Георгию Победоносцу, Симеону Богоприимцу и Николаю Чудотворцу, поэтому боковые престолы названы в их честь: Симеоно-Аннинский и Георгиевский.
Долгое время в Никольском Соборе хранилась казацкая реликвия. В 1883 году по настоянию Сибирского генерал-губернатора и атамана Сибирского казачьего войска Г.А. Колпаковского из города Березова с крестным ходом привезли боевое знамя Ермака, подаренное ему Строгановыми, разместили его в Никольском Казачьем Соборе. В 1918 году отряд атамана Б.В. Анненкова для спасения реликвии от большевиков увозит знамя из Омска.
В советское время Собор достраивали, разбирали купол и колокольню. После Великой Отечественной войны в нем располагался кинотеатр «Победа», затем детская музыкальная школа. Небольшое здание однокупольного храма в центре города чудом выстояло в годы повального атеизма. В силу отличных акустических характеристик в 1983 году в Соборе разместили Органный зал. Однако в 90-ые годы было решено перенести орган, поскольку его звуки разрушающе действовали на здание. В 1998 году Никольский Собор был передан Омско-Тарской епархии, проведены реставрационные работы, вернувшие храму его первоначальный вид.